港澳通行证签注两个月一次，是指每次入境港澳时，持证人可以停留不超过两个月。签注的有效期是从签发之日开始计算。例如，签注于2022年1月1日签发，那么每次入境港澳的停留期限是2022年1月1日起计算的连续两个月。如果持证人在签注有效期内未入境港澳，则签注无效，需要重新申请签注。
港澳通行证签注一次有效期根据不同情况而有所不同。个人旅游签注一般为3个月或6个月，团体旅游签注一般为15天或30天，商务签注一般为1年，学生签注一般为1年或2年。因此，具体的有效期取决于签注类型和签注规定。
根据中国公安部的规定，港澳通行证签注的有效期和停留期是有限制的。如果港澳通行证签注了3个月一次，那么在这个有效期内，每次在港澳停留的时间不能超过30天。如果想要更长时间停留或有多次进出港澳的需求，可以在签注到期前向公安局申请换发有效期更长的签注。但具体能否换发成功，需要根据申请人的个人情况和申请理由进行审查。