根据我查到的信息，上浦高速管理有限公司隶属于中国交通建设股份有限公司（简称“交建股份”），是其全资子公司。交建股份是国务院国资委监管的大型综合性建设企业，主要从事工程总承包、设计咨询、房地产开发等业务。
上饶市上浦高速项目建设管理有限公司成立于2018-12-19，法定代表人为陈幼华，注册资本为20000万元人民币，统一社会信用代码为91361100MA38AGBT56，企业地址位于江西省上饶市信州区丰溪路118号第四、五层，所属行业为土木工程建筑业，经营范围包含：高速公路项目投资、建设、运营、管理。（依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动）。上饶市上浦高速项目建设管理有限公司目前的经营状态为存续（在营、开业、在册）。
结论：上海浦东高速公路管理有限公司（简称“上浦高速管理有限公司”）的上级部门是上海市交通委员会。
原因：根据《关于印发上海市2014年以来领导干部任职前公示与反腐败个人申报工作实施细则的通知》和《上海市公共资源交易网》上的招标信息，确认了上浦高速管理有限公司的上级部门是上海市交通委员会。