河南农村自建房两层的面积标准根据地区有所不同。在山区、丘陵地区，每户宅基地面积不能超过200平方米；在人均耕地667平方米以上的平原地区，每户宅基地面积不得超过167平方米；而在城镇郊区和人均耕地667平方米以下的平原地区，每户宅基地面积不能超过134平方米。

请注意，这些规定是为了合理利用土地资源，确保农村自建房的合规性和安全性。具体的面积标准可能因地区和政策变化而有所不同，建议在申请建房前咨询当地相关部门了解最新规定。