员工工作期间旷工离职公积金和社保的处理方式为：劳动者应当回原用人单位办理离职手续，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理社会保险关系转移手续，劳动者可以持解除劳动合同证明到住房公积金管理中心和社保局分别办理住房公积金提取和社保转移手续。
按旷工日数计算工资，日工资数*天数。如无故旷工，对 公司 造成损失的话，公司有权要求你赔偿。如旷工天数符合公司规定 解除劳动合同 的要求，则可和你解除劳动合同。
离职公司不给转社保的，劳动者可以依法向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期办理。也可以向仲裁委员会申请劳动仲裁；对裁决结果不服的，可以向人民法院提起诉讼。